Εκτός απο αρχαιολογικό ενδιαφέρον έχει και ιστορική σημασία,καθώς το σπήλαιο έχει συνδεθεί με μία απο τις μεγαλύτερες τραγωδίες της ελληνικής ιστορίας.Τον Οκτώμβριο του 1823  γυναικόπαιδα και άντρες απο το χωριό κλείστηκαν μέσα για να περάσουν το χειμώνα,γιατι δεν άντεχαν το τούρκικο ζυγό.Οταν το έμαθε ο Χουσείν Μπέης τους είπε να παραδοθούν.Αυτοί ομως δεν θέλησαν να πέσουν στα χέρια των τούρκων και τους έβαλε φωτιά αφού πρώτα έκλεισε τις εισόδους του σπηλαίου.Πέθαναν απο ασφυξία.Στην κεντρική αίθουσα του σπηλαίου υπάρχει οστεοφυλάκειο .

Βρίσκεται 1800μ βορειο δυτικά του ομώνυμου χωριού,σε υψόμετρο 220μ,στη νότια πλευρά του όρους Κουλούκωνα.Λέγεται και Γεροντόσπηλιος και παρουσιάζει μεγάλο αρχαιολογικό ενδιαφέρον.Απο τις ανασκαφές προκύπτει,ότι το σπήλαιο υπήρχε κατα τη μεσομινωική περίοδο 2100-1600πχ και ηταν χώρος λατρείας.Εδώ λάτρευαν (απο μια επιγραφή που βρέθηκε στην είσοδο),τον 15ο αιώνα,τον Ταλαίο Ερμή.

ΣΠΗΛΑΙΟ ΜΕΛΙΔΟΝΙΟΥ

Το σπήλαιο στο ομώνυμο χωριό λέγεται Σφεντόνι απο έναν αντάρτη σφακιανό που είχε κρυφτεί εκεί.Βρίσκεται 52χλμ απο το Ρέθυμνο και είναι απο τα πιο μεγάλα σπήλαια και τα πιο σημαντικά της Ελλάδας. 

ΣΠΗΛΑΙΟ ΖΩΝΙΑΝΩΝ